Brad Anderson est passionné depuis son enfance par le cinéma où il tournait déjà des courts métrages en Super-8. Il fait d'abord ses études au Bowdoin College puis il part à Londres et entre à la London's International Film School.
Après sa formation il revient aux États Unis et travaille pour la PBS sur des documentaires. Une fois installé à Boston, il monte avec des amis réalisateurs de la même ville, le Boston Film Collective.
Il réalise ensuite un moyen métrage qui est un hommage à
Ed Wood : Frankenstein's Planet of Monsters !
Son premier long métrage The Darien Gap où il sera également metteur en scène, monteur et scénariste sort en 1996. Le film sera remarqué dans les festivals et notamment le Festival du film de Sundance 1996 (festival repris depuis les années 1990 par
Robert Redford).
Cela lui permet de réaliser son deuxième film, Et plus si affinités, et d'y diriger
Philip Seymour Hoffman. Il obtiendra le grand prix et celui du public au festival de Deauville en 1998.
En 1999 il réalise
Happy Accidents une comédie romantique teintée de science fiction, puis en 2001 Session 9, un thriller horrifique méconnu, à tort, du grand public.
Il se tourne alors vers la série TV et participe à la réalisation de quelques épisodes de différentes séries dont The Shield.
En 2005 il sort
The Machinist où
Christian Bale interprète un insomniaque anorexique et paranoïaque. Un film proche du cinéma de
David Lynch dont Brad Anderson revendique l'influence. Ce film est produit en Espagne, Hollywood refusant de le faire. Brad Anderson aura alors déclaré : " En Europe, le cinéma est encore une affaire de création, à la différence des États-Unis où la prise de risque ou le parti pris artistique ne signifient plus grand chose -il faut d'abord nourrir l'industrie. Je crois que, par tradition, les Européens sont plus réceptifs à la nuance, à des récits qui sortent un peu de la norme basique tant dans leur traitement que dans leur contenu "
Aujourd'hui il continue de participer à des séries (Les maîtres de l'horreur) et à sorti son dernier film en date en 2008, Transsibérien.